El sistema de membrana se basa en la operación continua como base de diseño, pero en la operación real, siempre habrá una cierta frecuencia de arranque y apagado.
Cuando se apaga el sistema de membrana, el agua permeada o el agua pretratada deben usarse para un lavado a baja presión para reemplazar el agua concentrada con una alta concentración pero que contiene inhibidor de incrustaciones del elemento de la membrana. También se deben tomar medidas para evitar que el agua se escape del sistema y entre aire, ya que puede haber una pérdida irreversible del flujo de permeado si el elemento pierde agua y se seca.
Si el tiempo de inactividad es inferior a 24 horas, no se requieren medidas para prevenir el crecimiento microbiano. Sin embargo, si el tiempo de inactividad excede las disposiciones mencionadas anteriormente, se debe usar líquido protector para la conservación del sistema o el sistema de membrana se debe enjuagar con regularidad.





